Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riox2Q8CD15 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms