Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RybpQ8CCI5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms