Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg4aQ8C9S8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms