Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm9949Q8C9F4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm9949Q8C9F4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm9949Q8C9F4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm9949Q8C9F4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm9949Q8C9F4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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