Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfibp1Q8C8U0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppfibp1Q8C8U0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms