Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apol7cQ8C6E1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apol7cQ8C6E1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms