Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lmbrd2Q8C561 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms