Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pggt1bQ8BUY9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Pggt1bQ8BUY9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Pggt1bQ8BUY9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Pggt1bQ8BUY9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms