Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep55Q8BT07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep55Q8BT07 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep55Q8BT07 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms