Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gga3Q8BMI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gga3Q8BMI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms