Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup107Q8BH74 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms