Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubash3bQ8BGG7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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