Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms