Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.5Q85ZW7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms