Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zer1Q80ZJ6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms