Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PhkbQ7TSH2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PhkbQ7TSH2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms