Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1cQ7TSF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1cQ7TSF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms