Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpf1Q7TND5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms