Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg4Q7TMD7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg4Q7TMD7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms