Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ScocQ78YZ6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ScocQ78YZ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms