Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sys1Q78S06 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sys1Q78S06 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sys1Q78S06 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms