Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssh1Q76I79 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms