Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nme8Q715T0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms