Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms