Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl35Q6ZWV7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl35Q6ZWV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 351.2 ms