Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc44a1Q6X893 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc44a1Q6X893 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms