Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9c1Q6UJY2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc9c1Q6UJY2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms