Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccsmst1Q6RUT7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccsmst1Q6RUT7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms