Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms