Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms