Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SvoplQ6PDF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SvoplQ6PDF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms