Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Herc4Q6PAV2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Herc4Q6PAV2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms