Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsen2Q6P7W5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsen2Q6P7W5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms