Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc148Q6P5U8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms