Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Colgalt2Q6NVG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms