Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HelbQ6NVF4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HelbQ6NVF4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms