Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SphkapQ6NSW3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SphkapQ6NSW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms