Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ltv1Q6NSQ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms