Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep78Q6IRU7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep78Q6IRU7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms