Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt40Q6IFX3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt40Q6IFX3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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