Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud6aQ6IE21 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud6aQ6IE21 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms