Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KdsrQ6GV12 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KdsrQ6GV12 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KdsrQ6GV12 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms