Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Atg9bQ6EBV9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9bQ6EBV9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg9bQ6EBV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms