Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pram1Q6BCL1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pram1Q6BCL1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pram1Q6BCL1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms