Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms