Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms