Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usf2Q64705 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf2Q64705 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms