Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja3Q64448 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja3Q64448 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms