Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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Clcn1Q64347 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn1Q64347 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn1Q64347 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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