Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup62Q63850 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms